Evolutsiooni käigus on taimed ja loomad välja töötanud kaitsemehhanismid, sealhulgas keemilised tõrjevahendid ja toksiinid, ründavate organismide vastu. Ründavad organismid on omakorda välja töötanud mehhanismid, mis võimaldavad neil võõrustada või muul viisil vastu seista oma peremeesorganismide kaitsekemikaalidele. Seega näib, et enamik kahjuriliike sisaldab juba geene, mis võimaldavad neil ensümaatiliselt lagundada või muul viisil vältida paljude kaasaegsete pestitsiididena välja töötatud kemikaalide toksilisi mõjusid. Seetõttu on pestitsiidiresistentsus geneetiliselt põhinev nähtus ja ilmneb siis, kui pestitsiidi kasutatakse populatsioonis, mis sisaldab mõningaid indiviide, kellel on geneetiline eelsoodumus olla selle pestitsiidi suhtes resistentne. Korduvad rakendused ja suuremad töötlemismäärad tapavad üha rohkem kahjureid, kuid resistentsed ellujääjad annavad resistentsuse geenid edasi järgmisele põlvkonnale. Kui ei kasutata teistsugust ravirežiimi, kasvab populatsioonis üha rohkem resistentseid kahjureid ja kõrge paljunemisvõime korral, nt putukate puhul, muutub kogu populatsioon kiiresti resistentseks.
Kui kahjur on teatud pestitsiidi suhtes välja arendanud, on vaja selle tõrjeks muid vahendeid. Üheks meetodiks on kasutada teistsugust pestitsiidi, eriti teisest keemilisest klassist pärit pestitsiidi, millel on erinev kahjurivastane toime. Siiski tuleb jälgida, et populatsioonis ei tekiks mitmekordset resistentsust, st resistentsust mitme pestitsiidide klassi suhtes. Parim strateegia on vältida resistentse populatsiooni moodustamist ja selleks on välja töötatud erinevad protseduurid. Pestitsiidide kasutamise tõttu resistentsete populatsioonide tekke vältimiseks on soovitatud kasutada erinevaid juhtimisstrateegiaid. USA EPA ja Kanada PMRA on koostanud vabatahtliku märgistamisskeemi koos soovitustega vastupanu vältimiseks, andes kasutajatele teavet tegevusviisi ja sihtkoha kohta.